십각류 범용 DNA 메타바코딩 분석키트
제품 설명
AquaAmp® Decapods META Universal PCR Kit (Ver. 1.0) (Cat. No. AGTC-PB13-100)는 국립해양생물자원관의 특허기술로 무척추동물 십각류의 DNA 메타바코딩을 위해 제작된 프라이머 조합, DNA 중합효소, dNTPs, 반응용액 등 PCR 증폭반응 수행에 필요한 구성성분이 모두 혼합된 제품입니다(특허출원번호 제10-2023-0168517호).
특징 및 장점
십각류의 DNA 메타바코딩을 위해 사용되는 PCR 프라이머 조합은 미토콘드리아 16S 리보솜 RNA 유전자 (16S rDNA) 영역 안에 위치하여 PCR 증폭반응과 차세대염기서열분석(Next Generation Sequencing, NGS)을 통해 수생태계의 생물다양성 또는 유전다양성, 서식지 특성, 생활사를 분석하는 데 사용됩니다. 특히 이들 순방향과 역방향 프라이머 조합는 상보적으로 결합하는 16S rRNA 유전자 영역의 유전변이를 거의 모두 반영되도록 설계되어 기존 무척추동물의 분자마커와 비교하여 PCR 증폭반응의 성공률을 획기적으로 높여줍니다. 이 키트는 환경수에서 추출된 환경 DNA (environmental DNA, eDNA)의 메타바코딩(metabarcoding) 분석에 편리하게 활용됩니다. 또한, 각 PCR 프라이머의 5' 말단에 Illumina 어댑터가 부착되어 있어 NGS 분석을 쉽게 수행할 수 있습니다.
