DNA 메타바코딩(DNA metabarcoding)이란 PCR 증폭반응과 차세대염기서열분석(next generation sequencing, NGS)에 기초하여 생태계 내에 서식하는 생물들의 다양성을 온전히 분석하는 방법입니다. 전통적인 채집과 배양, 분류에 의존하지 않으며,
환경DNA를 포함하는 환경유기물, 포식동물 배설물 등과 같이 생물의 일부 조직만 남아있어도 그 생물의 다양성을 분석할 수 있으며, 멸종위기종, 희귀종 또는 미기록종의 존재 여부를 파악할 수 있습니다.
DNA 메타바코딩 분석을 위해서는 표적분류군에 속하는 모든 종을 균일하게 증폭할 수 있고 유전변이가 적당히 높아 종수준까지 구별할 수 있으며, 필요에 따라 표적분류군 이외의 분류군을 배제할 수 있는 PCR 프라이머 조합을 사용해야 합니다.
아쿠아진텍(주)은 세균(bacteria)과 진핵생물(eukaryotes)의 생물다양성 분석뿐만 아니라 표적분류군 특이적인 PCR 프라이머 조합을 자체적으로 설계하고(예: 어류, 환형동물 등) 이를 활용하여 생물다양성을 더욱 정밀하게 분석합니다.
DNA 메타바코딩 분석과정
1. 라이브러리 제작
- 환경DNA 추출
- 1차 PCR 증폭반응
- 2차 PCR 증폭반응
- NGS 분석
2. 생물정보학적 분석
- 어댑터 자르기 등
- OTU 만들기
- 분류학적 위치 결정
- 생물다양성 분석