Bộ PCR kit AquaAmp®
Fish BOL Freshwater PCR
Fish BOL Freshwater PCR
Bộ dụng cụ AquaAmp® Fish BOL Freshwater PCR Kit được phát triển dựa trên công nghệ đã được cấp bằng sáng chế của công ty trách nhiệm hữu hạn AquaGenTech (số áp dụng 10-1955124, Korean Intellectual Property Office). Bộ dụng cụ bao gồm tất cả các thuốc thử PCR (bao gồmcác đầu mồi, DNA polymerase, dNTPs, chất điệm, v.v.) để mã hóa DNA. Chỉ DNA bộ gen (genomic DNA) của các mẫu vật cần được chuẩn bị để phân tích bằng bộ dụng cụ này.
Bộ mồi PCR bao gồm ba đoạn mồi thuận và nghịch liên kết với gen cytochrome c oxidase 1 của ty thể (CO1), vùng mã vạch DNA tiêu chuẩn vàng cho động vật. Bộ mồi sẽ gắn vào các vùng tRNA-Tyr và tRNA-Ser nằm lần lượt ở trên và ở dưới của gen CO1, và tạo ra một dải PCR duy nhất với kích thước amplicon là 1500 bp sau khi khuếch đại với PCR thường. Các đoạn mồi được thiết kế đủ bảo toàn để có khả năng liên kết với hầu như tất cả các loài cánước ngọt, tạo điều kiện thuận lợi cho các nhà nghiên cứu tạo ra các các dải PCR duy nhất rõ ràng với tỉ lệ thành công đáng kế hơn so với các đầu mồi được thiết kế bởi Ivanova và cộng sự (2007). Bộ dụng cụ này có thể dễ dàng áp dụng để mã hóa DNA của các loài cá tươi (trứng, cá con, các mô cá trưởng thành) và các mẫu thực phẩm đã qua chế biến. Ngoài ra các nhà nghiên cứu cũng đã thuận tiện thực hiện việc giải trình DNA với việc sử dụng các adaptor chuyên biệt gắn vào các đầu cuối 5’ của cả cặp mồi thuận và mồi nghịch.
Hiệu xuất của bộ dụng cụ AquaAmp® Fish BOL Freshwater PCR Kit được xác thực bằng việc sử dụng 21 mẫu cá tươi nước ngọt thuộc các nhóm phân loại khác nhau (ví dụ như Perciformes, Beloniformes, Synbranchiformes, Siluriformes, Osmeriformes, Mugiliformes, Scorpaeniformes, Cypriniformes, và Gasterosteiformes). Tất cả các mẫu đều thành công tạo ra các dải PCR duy nhất rõ ràng với đúng kích thước amplicon như dự kiến.