Bộ PCR kit AquaAmp®
Fish META Universal
Fish META Universal
Bộ dụng cụ AquaAmp® Fish META Universal PCR Kit được phát triển dựa trên công nghệ đã được cấp bằng sáng chế của công ty trách nhiệm hữu hạn AquaGenTech (số áp dụng 10-2367357, Korean Intellectual Property Office). Bộ dụng cụ bao gồm tất cả các thuốc thử PCR (Bao gồm các đầu mồi, DNA polymerase, dNTPs, chất đệm, v.v.) để siêu mã hóa DNA cho cá. DNA môi trường (eDNA) từ các mẫu môi trường cần được chuẩn bị để phân tích bằng bộ dụng cụ này.
Bộ mồi PCR bao gồm mỗi đoạn mồi thuận và nghịch liên kết với gen RNA ribosome 16S của ty thể (16S rDNA), vùng mã vạch ADN thay thế của động vật. Bộ mồi tạo ra một dải PCR duy nhất với kích thước amplicon là 400 bp sau khi khuếch đại với PCR thường. Các đoạn mồi được thiết kế đủ bảo toàn để có khả năng liên kết với hầu như tất cả các loài cá, tạo điều kiện thuận lợi cho các nhà nghiên cứu tạo ra thành công các dải PCR duy nhất rõ ràng. Bộ dụng cụ này có thể dễ dàng áp dụng cho việc siêu mã hóa ADN các mẫu môi trường nơi cá thường sinh sống. Ngoài ra, các nhà nghiên cứu cũng đã thuận tiện thực hiện phân tích giải trình tự mới (NGS) bằng cách sử dụng các overhang cho phép Illumina HiSeq® và MiSeq® gắn vào các đầu cuối 5'của cả mồi thuận và nghịch. Các phân tích tin sinh học đã cho thấy tỉ lệ cao thành phần các loài cá.
