AquaAmp®
Fish BOL Marina PCR Kit
AquaAmp® Fish BOL Marina PCR Kit
AquaAmp® Fish BOL Marina PCR Kit ได้รับการพัฒนาโดยใช้เทคโนโลยีที่จดสิทธิบัตรของบริษัทAquaGenTech Co., Ltd. (หมายเลขทะเบียน 10-1955124, สำนักงานทรัพย์สินทางปัญญาประเทศเกาหลี) ชุดตรวจสอบประกอบด้วยรีเอเจนต์ทั้งหมดของการทำPCR สำหรับบาร์โค้ดดีเอ็นเอ (DNA barcoding)ของปลาทะเล(เช่น ไพรเมอร์,เอนไซม์ DNA polymerase, dNTP,บัฟเฟอร์ ฯลฯ) ดังนั้นสำหรับการวิเคราะห์โดยใช้ชุดทดสอบนี้จึงเตรียมเฉพาะจีโนม DNA ของตัวอย่างเท่านั้น
ชุดไพรเมอร์ PCR ประกอบด้วยไพรเมอร์ที่มีลำดับเบสเข้าคู่กับยีน cytochrome c oxidase 1 (CO1) ในไมโทคอนเดรีย จับที่ปลายทั้งสองด้านแบบไปข้างหน้าและย้อนกลับซึ่งเป็นขอบเขตมาตรฐานของบาร์โค้ด DNA สำหรับสัตว์ ชุดไพรเมอร์หลอมละลายบริเวณ tRNA-Tyr และ tRNA-Ser ที่อยู่ต้นสายและปลายสายของยีนCO1 ตามลำดับ และสร้างแถบ PCR เดี่ยวที่มีขนาดแอมพลิคอนประมาณ 1,500 bp หลังจากการทำPCR แบบธรรมดา ไพรเมอร์ได้รับการออกแบบมาเพื่อให้สามารถใช้ได้กับปลาทะเลเกือบทุกชนิด ซึ่งช่วยให้นักวิจัยสามารจถผลิตแถบ PCR เดี่ยวที่ชัดเจนและมีอัตราความสำเร็จที่สูงกว่าที่ออกแบบโดยบริษัทIvanova et al.(2007). ชุดอุปกรณ์นี้สามารถนำไปใช้กับบาร์โค้ดDNA ของปลาที่ยังมีชีวิต (ไข่ เนื้อเยื่อตัวอ่อนและตัวเต็มวัย) และตัวอย่างอาหารแปรรูปได้อย่างง่ายดาย นอกจากนี้นักวิจัยได้ทำการจัดลำดับ DNAที่สะดวกต่อการใช้งานโดยใช้อะแดปเตอร์เฉพาะที่ติดอยู่กับขั้ว 5′ ของไพรเมอร์ทั้งแบบเดินหน้าและถอยหลัง
AquaAmp®Fish BOL Marina PCR Kit
ประสิทธิภาพของ AquaAmp® Fish BOL Marina PCR Kit ได้รับการตรวจสอบโดยใช้ตัวอย่างปลาสดและแห้งจากทะเล 27 ชนิดที่อยู่ในกลุ่มอนุกรมวิธานที่หลากหลาย (เช่น Rajiformes, Acipenseriformes, Anguilliformes, Clupeiformes, Salmoniformes, Gadiformes, Lophiiformes, Gasterosteiformes, Perciformes, Pleuronectidoni และ Scorpaeniformes) และตัวอย่างอาหารแปรรูป (อาหารเค็มและกระป๋อง) ซึ่งตัวอย่างทั้งหมดสามารถผลิตแถบ PCR เดี่ยวที่ชัดเจนพร้อมกับได้ขนาดแอมพลิคอนที่คาดไว้