AquaGenTech

ชุดไพรเมอร์ PCR ประกอบด้วยไพรเมอร์แบบไปข้างหน้าและย้อนกลับโดยแต่ละตัวจับกับยีน16S ribosomal RNA gene (16S rDNA) ในไมโทคอนเดรีย ซึ่งเป็นบริเวณบาร์โค้ดดีเอ็นเอของสัตว์ที่มีการถอดรหัส ชุดไพรเมอร์จะผลิตแถบ PCR `เดี่ยวที่มีขนาดแอมพลิคอนประมาณ400 bp หลังจากการทำ PCR แบบธรรมดา ไพรเมอร์ได้รับการออกแบบมาเพื่อให้ได้กับปลาเกือบทุกชนิด ซึ่งช่วยให้นักวิจัยประสบความสำเร็จในการผลิตแถบ PCR เดี่ยวที่ชัดเจน ชุดอุปกรณ์นี้สามารถนำไปใช้กับ DNAmetabarcodingของตัวอย่างสิ่งแวดล้อมที่ปลามักอาศัยอยู่ได้อย่างง่ายดาย นอกจากนี้นักวิจัยยังได้ทำการวิเคราะห์ข้อมูลที่มีความสะดวกรวดเร็วโดยวิธีhigh-throughput NGS ซึ่งอาศัยการวิเคราะห์ลำดับเบสแบบIllumina HiSeq®และ MiSeq®ที่ติดกับขั้วต่อ 5′ ของไพรเมอร์ทั้งแบบเดินหน้าและถอยหลัง ซึ่งการวิเคราะห์ทางชีวสารสนเทศพบว่ามีอัตราองค์ประกอบชนิดของปลาที่สูงเป็นพิเศษ