AquaAmp®
Fish BOL Universal PCR Kit
Fish BOL Universal PCR Kit
AquaAmp® Fish BOL Universal PCR Kit ได้รับการพัฒนาโดยใช้เทคโนโลยีที่จดสิทธิบัตรของบริษัทAquaGenTech Co., Ltd. (ทะเบียนเลขที่ 10-2367357,สำนักงานทรัพย์สินทางปัญญาของประเทศเกาหลี) ชุดตรวจสอบประกอบด้วยรีเอเจนต์ทั้งหมดของการทำ PCR สำหรับบาร์โค้ดดีเอ็นเอ (DNA barcoding) ของปลาทะเล (เช่น ไพรเมอร์, เอนไซม์ DNA polymerase, dNTP, บัฟเฟอร์ ฯลฯ) ดังนั้นสำหรับการวิเคราะห์โดยใช้ชุดทดสอบนี้จึงเตรียมเฉพาะจีโนม DNA ของตัวอย่างเท่านั้น
ชุดไพรเมอร์ PCR ประกอบด้วยไพรเมอร์แบบไปข้างหน้าและย้อนกลับโดยแต่ละตัวจับกับยีน16S ribosomal RNA gene (16S rDNA) ในไมโทคอนเดรียซึ่งเป็นบริเวณบาร์โค้ดดีเอ็นเอของสัตว์ที่มีการถอดรหัส ชุดไพรเมอร์จะผลิตแถบ PCR `เดี่ยวที่มีขนาดแอมพลิคอนประมาณ400 bp หลังจากการทำPCR แบบธรรมดา ไพรเมอร์ได้รับการออกแบบมาเพื่อให้ได้กับปลาเกือบทุกชนิด ซึ่งช่วยให้นักวิจัยประสบความสำเร็จในการผลิตแถบ PCR เดี่ยวที่ชัดเจน ชุดตรวจสามารถนำมาใช้ในการวิเคราะห์ DNA `ได้ทั้งปลาสดและตัวอย่างอาหารแปรรูปได้อย่างง่ายดาย นอกจากนี้นักวิจัยได้ทำการจัดลำดับ DNA ที่สะดวกต่อการใช้งานโดยใช้อะแดปเตอร์เฉพาะที่ติดอยู่กับขั้ว 5′ ของไพรเมอร์ทั้งแบบเดินหน้าและถอยหลัง
ประสิทธิภาพของ AquaAmp® Fish BOL Universal PCR Kit ได้รับการตรวจสอบโดยใช้ตัวอย่างปลาทะเลและน้ำจืด 21 ตัวอย่างที่อยู่ในกลุ่มอนุกรมวิธานที่หลากหลาย (เช่น Pleuronectiformes, Perciformes, Gadiformes, Beloniformes, Synbranchiformes, Siluriformes, Osmeriformes, Anguilliformes, Tetraodontiformes, Synbranchiformes, Synbranchiformes, Siluriformes, Osmeriformes,Anguilliformes, Tetraodontiformes, Synbranchiformes, Synbranchiformes, Lophiiformes, Salmoniformes, Chimaeriformes, Cypriniformes, Acipensiformes, Clupeiformes, Kurtiformes และGasterosteiformes) ซึ่งตัวอย่างทั้งหมดสามารถผลิตแถบ PCR เดี่ยวที่ชัดเจนพร้อมกับได้ขนาดแอมพลิคอนที่คาดไว้